① 金堂（重要文化財）

国宝のご本尊大日如来、両脇侍の降三世明王・不動明王を祀る。

② 多宝塔（重要文化財）

初層内部には、大日如来が安置され、極彩色の仏の世界が描かれている。

③ 楼門（重要文化財）

重要文化財の二天（増長天・持国天）が安置され、寺を守っている。

④ 食堂（重要文化財）

南北朝時代に後村上天皇が約５年間政務をとられた。

⑤ 御影堂（重要文化財）

重要文化財の弘法大師御影（画像）を祀る。南北朝時代に観月亭が付設された。

⑥ 薬師堂（重要文化財）

府指定文化財の薬師如来、両脇侍の 日光菩薩 ・月光菩薩、眷属の十二神将が祀られている。

⑦ 五佛堂（重要文化財）

重要文化財の五智如来（大日如来・阿閦如来・藥師如来・宝生如来・阿弥陀如来・不空成就如来）が祀られている。

⑧ 奥殿（国登録文化財）

南北朝時代、約３年間幽閉された北朝三上皇（光厳・崇光・光明）の御座所とされた。

⑨ 摩尼院（重要文化財）

南北朝時代、後村上天皇が約５年間御座所とされた。90近くあった子院の中でも有力子院であった。

⑩ 八十八ヶ所霊場

四国八十八か所霊場のお砂を勧請し、誰でもが巡拝できる。

⑪ 天野街道

西高野街道から分岐し、当寺に至る街道。通る天野谷は中世の風景を残す。

●日本遺産

当寺は令和元年度に認定された「中世に出逢えるまち」と令和２年度に認定された「女性とともに今に息づく女人高野」の主要な構成文化財になっている。